汉时九华山称陵阳山，南梁称帻山，唐初称九子山，曾是道教名山，从西汉至东晋陆续有些名人进山修炼，唐代九华山道教更为兴盛，开元年间建有开元观，以及延华观，九华山成为道家“三十九福地”，天下闻名。唐时期佛教在九华山得到广泛传播，佛教寺庙遍布山上，与佛教有关的传说日积月累越来越多，各种法会、庙会很有影响，明朝时九华山与五台山、峨眉山、普陀山并称佛教四大名山。
九华山佛教的开山祖师为东晋的天竺僧杯渡尊者，他所居的化城寺被尊为九华山的开山祖寺，距今已有1300（1600？）多年历史，该寺内现有“九华山历史文物馆”。九华山很知名的一种奇观是历经数百年形成的十多尊僧人肉身，即僧人寂灭后其身体不腐，后世人将肉身装金祭拜，以示尊敬，唐代的新罗僧金乔觉（696年-794年）是九华山第一位肉身不腐的僧人，被尊为地藏菩萨。据记载金乔觉于唐开元年间来华，到达九华山后在一处岩洞中修行，九华山是青阳县闵让和员外的属地，他见识过金乔觉的高德后，将整座山献给菩萨，此后九华山兴修庙宇，成为佛教宣扬佛法的道场。闵员外的儿子拜金乔觉为师，法号道明，后闵员外也出家为僧，所以九华山的多处庙宇里供奉的地藏菩萨像多由三人组成，居中者为金地藏，两旁的为闵员外和其子。
寺庙与民居混杂在一起是九华山风景区内的一个特点，游客通常先乘车到九华街，街上店铺林立，像是繁华的闹市，由于九华山曾吸引过许多名人到访或居住，这里的书堂、书院、书舍、精舍也很多。在街市前端有一所精致的小寺庙——百岁宫下院，进门照例是佛像，有观音殿，不太大，可从敞开的门看到内堂陈设，使景物显出层层递进的模式，很得中国古典园林的妙处。百岁宫下院街对面是祗（衹）园禅寺，是一座历史悠久的寺庙，原名祗（衹）树庵，清朝时新修殿宇，后历代主持对禅寺修建、扩建，使之成为九华山重要的寺庙，整个建筑群为宫殿式与民居式建筑的融合，体现了古典建筑之美，许多到九华山拜佛的人都喜欢到祗（衹）园寺观瞻。
真身宝殿又称“肉身殿”，位于九华山神光岭上，供奉着地藏菩萨，是一处主要的佛教场所。寺庙依山而建，与九华老街相隔不远的山门高大巍峨，然后是弥陀殿、地藏禅寺，山上是护国肉身宝塔，殿前有钟楼和鼓楼，殿内有七层八面木质宝塔一座，内供地藏金色坐像，拜佛上香的人总是很多，也许佛和菩萨真能帮助人们实现愿望。据记载安徽省1992年春重修肉身殿，1999年冬竣工，肉身宝殿于1993年9月15日重建完成，整体建筑是宫殿式，巍峨雄伟，距今已有些时日，显得有些陈旧。
肉身殿后面有条山路，通往小天台，路不太长，沿途有些小寺庙，内供佛像明显较小，香火不太旺盛，佛像的形制有地藏菩萨的影响。上禅堂距肉身殿很近，原名景德堂，始建于明代，其后屡有名人题字，其建筑古朴典雅，游人众多。出了上禅堂下行不远是净土庵，外形较新，大约是一处尼姑修行的处所。
九华街上有一处殿宇雄伟阔大的寺庙，多半是旃檀禅林，高大的前门和殿宇在很远处就可以看到，进门是笑口常开的弥勒佛和韦驮菩萨，二者背对背，似乎在守护着大门；里面的大愿宝殿很有些历史，廊柱上的石雕精巧细致，寺内有四面佛（是地藏菩萨的形象），许多佛教徒对高大的佛像顶礼膜拜。
百岁宫是一处著名景点，需爬些山路才能到达。据说明朝万历年间，一位名无暇的和尚在山上苦修，逝后三年人们发现他的遗体，奇的是遗体未腐，在肉身旁有他书写的《血经》和自身经历，后明崇祯帝封他为“应身菩萨”，供奉无暇（释海玉）和尚肉身的寺庙为摘星庵，后名百岁宫，匾额上有“钦赐百岁宫护国万年寺”几个字。距百岁宫不远处是五百罗汉堂，其下层供奉着佛像，上面一层有排列整齐的罗汉像和佛像，身在其中的人们不觉肃然起敬。百岁宫一带有许多野猴，不怕游人，也不惧拍照，蹲坐在栏杆上的野猴显得顽皮可爱有趣，大概是不缺食物的缘故，猴子显得比较肥大。东崖禅寺建在山顶上，石阶上有一个飞檐翘角的亭子，外形优美，远观也非常漂亮，属中国古典建筑的代表；沿石阶上去后是寺庙主体，里面供奉的佛像不甚大，大概这里地势高，难形成规模庞大的建筑群，不过历史上到过东崖禅寺的名人却很多，“东崖晏坐”是指和尚在此修行打坐，体悟佛理。
慧居寺原名慧庆庵，位于九华山西麓，始建于清代，周围群山环绕、绿树掩映，由大雄宝殿、地藏殿、观音楼和藏经楼等建筑组成，上天台的山路需经过慧居寺，大概爬山的人较少，虽然经过慧居寺的路狭窄，并不觉拥挤。寺庙经过重修，新旧混杂在一起，据说有的佛像是民国时修建，有的是九十年代修建，还有的似在建造中。经过慧居寺向上不远就是吉祥寺，一个不大的寺庙，里面供奉的佛像较小，吉祥寺的位置很独特，站在这里向前可以看到对面山上的万佛塔、东崖禅寺、五百罗汉堂等建筑，向山上可以看到险峻的山峰及山上的寺庙。
九华山风景区山脚下是九华新街，附近房屋似是新修，干净整洁，青灰色屋顶和白墙，雕花的栏杆以及独具特色的徽派马头墙，街上的桥、塔、路灯都显得古朴典雅。山下有新建的九华山大愿文化园，里面有弘愿堂、佛光池、大愿广场、99米高地藏菩萨圣像，这里的建筑处处显示出佛教文化的印记，却不像是寺庙，游人在此可以了解许多佛教知识、传说，特别是地藏菩萨的故事。九华山佛教历史悠久，典故众多，其兴盛热闹与长期的佛教传承有关系，前来礼佛上香的人多半不会失望，至少美丽的风景令人陶醉，可以暂时忘却世俗的忙乱。
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